Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms