Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm11487Q5RIS0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm11487Q5RIS0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms