Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtp3Q5QGU6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms