Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rapgef6Q5NCJ1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef6Q5NCJ1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms