Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Ttf2Q5NC05 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms