Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Taf3Q5HZG4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms