Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnni3kQ5GIG6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3kQ5GIG6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms