Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm3Q5F4S9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpm3Q5F4S9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpm3Q5F4S9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms