Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig2Q52KR2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms