Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q504N7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q504N7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q504N7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q504N7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q504N7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q504N7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q504N7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q504N7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q504N7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q504N7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q504N7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q504N7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q504N7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q504N7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q504N7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q504N7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q504N7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q504N7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q504N7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q504N7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q504N7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q504N7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q504N7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q504N7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q504N7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q504N7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q504N7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q504N7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q504N7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q504N7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q504N7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q504N7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q504N7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q504N7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q504N7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q504N7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q504N7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q504N7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q504N7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q504N7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q504N7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q504N7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q504N7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q504N7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q504N7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q504N7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q504N7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q504N7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q504N7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q504N7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q504N7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q504N7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q504N7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q504N7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q504N7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q504N7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q504N7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q504N7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q504N7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q504N7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q504N7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q504N7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q504N7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q504N7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q504N7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q504N7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q504N7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q504N7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q504N7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q504N7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q504N7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q504N7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q504N7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q504N7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q504N7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms