Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2K7

1700123L14Rik, RIKEN cDNA 1700123L14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123L14RikQ3V2K7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
1700123L14RikQ3V2K7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700123L14RikQ3V2K7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms