Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmub2Q3V209 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms