Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd5Q3V1H9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd5Q3V1H9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms