Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms