Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330034G19RikQ3UWX6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms