Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ScimpQ3UU41 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScimpQ3UU41 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms