Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thsd4Q3UTY6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms