Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms