Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS9

Ccdc51, Coiled-coil domain-containing protein 51, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc51Q3URS9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc51Q3URS9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc51Q3URS9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc51Q3URS9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc51Q3URS9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc51Q3URS9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms