Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQN2

Fcho2, F-BAR domain only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho2Q3UQN2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho2Q3UQN2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho2Q3UQN2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho2Q3UQN2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho2Q3UQN2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho2Q3UQN2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho2Q3UQN2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho2Q3UQN2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho2Q3UQN2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho2Q3UQN2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho2Q3UQN2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho2Q3UQN2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho2Q3UQN2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho2Q3UQN2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho2Q3UQN2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho2Q3UQN2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho2Q3UQN2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fcho2Q3UQN2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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