Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D13Ertd608eQ3UPR8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms