Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cep63Q3UPP8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms