Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms