Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpr55Q3UJF0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpr55Q3UJF0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms