Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms