Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitpnm3Q3UHE1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms