Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnrc6cQ3UHC0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnrc6cQ3UHC0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6cQ3UHC0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms