Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plxnd1Q3UH93 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxnd1Q3UH93 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms