Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms