Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nom1Q3UFM5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nom1Q3UFM5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nom1Q3UFM5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 311.6 ms