Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Puf60Q3UEB3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms