Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Yipf3Q3UDR8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Yipf3Q3UDR8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms