Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms