Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf180Q3U827 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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