Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp6Q3U6U5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms