Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd3Q3U487 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hectd3Q3U487 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms