Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vars2Q3U2A8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vars2Q3U2A8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms