Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tatdn3Q3U1C6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tatdn3Q3U1C6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms