Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms