Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd1Q3TXS7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd1Q3TXS7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms