Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc136Q3TVA9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc136Q3TVA9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms