Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
D17Wsu92eQ3TT38 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms