Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdnep1Q3TP92 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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