Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Smarca4Q3TKT4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Smarca4Q3TKT4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Smarca4Q3TKT4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms