Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pdlim7Q3TJD7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdlim7Q3TJD7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms