Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp39Q3TIX9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp39Q3TIX9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms