Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms