Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RubcnlQ3TD16 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms