Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc69Q3TCJ8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms