Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms